Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD6O43541 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD6O43541 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMAD6O43541 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms