Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7O15265 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7O15265 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7O15265 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7O15265 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7O15265 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN7O15265 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN7O15265 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms