Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBFD1O14562 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBFD1O14562 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBFD1O14562 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBFD1O14562 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBFD1O14562 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBFD1O14562 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBFD1O14562 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBFD1O14562 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBFD1O14562 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBFD1O14562 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms