Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms