Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms