Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCCD1A6NED2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCCD1A6NED2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms