Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPEF1Q9Y4P9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPEF1Q9Y4P9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPEF1Q9Y4P9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPEF1Q9Y4P9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPEF1Q9Y4P9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPEF1Q9Y4P9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPEF1Q9Y4P9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPEF1Q9Y4P9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPEF1Q9Y4P9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPEF1Q9Y4P9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPEF1Q9Y4P9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPEF1Q9Y4P9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms