Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HPSEQ9Y251 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HPSEQ9Y251 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPSEQ9Y251 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms