Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCOLCE2Q9UKZ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms