Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
C2orf42Q9NWW7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C2orf42Q9NWW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.7 ms