Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLE1Q9NVX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLE1Q9NVX2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLE1Q9NVX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms