Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTORQ9NRC9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
OTORQ9NRC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTORQ9NRC9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTORQ9NRC9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTORQ9NRC9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms