Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VIPAS39Q9H9C1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIPAS39Q9H9C1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms