Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLDIP3Q9BY77 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLDIP3Q9BY77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms