Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL25A1Q9BXS0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL25A1Q9BXS0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms