Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP3Q9BWW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP3Q9BWW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP3Q9BWW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP3Q9BWW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP3Q9BWW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP3Q9BWW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP3Q9BWW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP3Q9BWW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms