Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A23Q9BV35 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC25A23Q9BV35 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC25A23Q9BV35 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A23Q9BV35 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC25A23Q9BV35 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A23Q9BV35 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A23Q9BV35 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms