Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRI1Q9BV20 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRI1Q9BV20 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms