Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD1Q9BUP0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHD1Q9BUP0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD1Q9BUP0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms