Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGPAT1Q99943 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGPAT1Q99943 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms