Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SETDB2Q96T68 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SETDB2Q96T68 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SETDB2Q96T68 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 690.3 ms