Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXNL1Q96CM4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NXNL1Q96CM4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXNL1Q96CM4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms