Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHD5Q8TDI0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD5Q8TDI0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD5Q8TDI0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms