Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACVR1CQ8NER5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVR1CQ8NER5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms