Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM35BQ8NCS4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM35BQ8NCS4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms