Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC18Q8N456 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC18Q8N456 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms