Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT2Q7L5N7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms