Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIAT1Q6ZQX7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms