Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDE2Q6IQ49 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SDE2Q6IQ49 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms