Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM225Q6GV28 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM225Q6GV28 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM225Q6GV28 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms