Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX30Q5VWJ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
SNX30Q5VWJ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX30Q5VWJ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms