Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZK1Q5T2W1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZK1Q5T2W1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZK1Q5T2W1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms