Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP78Q5JTW2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP78Q5JTW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms