Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ECM1Q16610 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ECM1Q16610 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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