Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX2Q16385 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SSX2Q16385 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SSX2Q16385 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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SSX2Q16385 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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SSX2Q16385 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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SSX2Q16385 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SSX2Q16385 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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