Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.4 ms