Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARDQ03181 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPARDQ03181 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms