Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE1BQ01064 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE1BQ01064 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms