Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCKSL1P49006 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCKSL1P49006 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms