Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ETV4P43268 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ETV4P43268 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ETV4P43268 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV4P43268 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV4P43268 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV4P43268 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV4P43268 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV4P43268 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ETV4P43268 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV4P43268 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV4P43268 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV4P43268 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV4P43268 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV4P43268 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV4P43268 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV4P43268 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV4P43268 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ETV4P43268 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV4P43268 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV4P43268 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV4P43268 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV4P43268 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV4P43268 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ETV4P43268 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV4P43268 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV4P43268 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV4P43268 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ETV4P43268 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ETV4P43268 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ETV4P43268 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ETV4P43268 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ETV4P43268 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ETV4P43268 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ETV4P43268 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ETV4P43268 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETV4P43268 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETV4P43268 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETV4P43268 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETV4P43268 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETV4P43268 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETV4P43268 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETV4P43268 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETV4P43268 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETV4P43268 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ETV4P43268 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ETV4P43268 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ETV4P43268 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ETV4P43268 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ETV4P43268 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ETV4P43268 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ETV4P43268 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ETV4P43268 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ETV4P43268 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ETV4P43268 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ETV4P43268 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ETV4P43268 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ETV4P43268 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ETV4P43268 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ETV4P43268 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ETV4P43268 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ETV4P43268 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ETV4P43268 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETV4P43268 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETV4P43268 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETV4P43268 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETV4P43268 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETV4P43268 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETV4P43268 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETV4P43268 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETV4P43268 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ETV4P43268 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ETV4P43268 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ETV4P43268 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ETV4P43268 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ETV4P43268 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ETV4P43268 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ETV4P43268 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ETV4P43268 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ETV4P43268 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ETV4P43268 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ETV4P43268 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ETV4P43268 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ETV4P43268 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ETV4P43268 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ETV4P43268 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ETV4P43268 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ETV4P43268 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ETV4P43268 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ETV4P43268 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ETV4P43268 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ETV4P43268 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ETV4P43268 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ETV4P43268 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ETV4P43268 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ETV4P43268 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ETV4P43268 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ETV4P43268 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ETV4P43268 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ETV4P43268 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 441.3 ms