Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP214P35658 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP214P35658 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP214P35658 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP214P35658 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NUP214P35658 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP214P35658 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP214P35658 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP214P35658 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP214P35658 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP214P35658 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP214P35658 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP214P35658 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP214P35658 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUP214P35658 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP214P35658 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP214P35658 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP214P35658 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP214P35658 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP214P35658 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP214P35658 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP214P35658 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP214P35658 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP214P35658 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP214P35658 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP214P35658 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP214P35658 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP214P35658 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP214P35658 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP214P35658 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP214P35658 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP214P35658 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP214P35658 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP214P35658 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP214P35658 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP214P35658 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP214P35658 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NUP214P35658 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP214P35658 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP214P35658 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP214P35658 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP214P35658 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP214P35658 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP214P35658 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP214P35658 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP214P35658 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP214P35658 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP214P35658 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP214P35658 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP214P35658 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP214P35658 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP214P35658 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP214P35658 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP214P35658 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP214P35658 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP214P35658 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP214P35658 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP214P35658 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP214P35658 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP214P35658 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP214P35658 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP214P35658 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP214P35658 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP214P35658 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP214P35658 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP214P35658 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP214P35658 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP214P35658 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP214P35658 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP214P35658 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP214P35658 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP214P35658 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP214P35658 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP214P35658 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP214P35658 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP214P35658 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP214P35658 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP214P35658 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP214P35658 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP214P35658 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP214P35658 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP214P35658 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP214P35658 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP214P35658 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP214P35658 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP214P35658 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP214P35658 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP214P35658 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP214P35658 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP214P35658 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP214P35658 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP214P35658 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP214P35658 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP214P35658 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP214P35658 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP214P35658 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP214P35658 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP214P35658 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP214P35658 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP214P35658 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms