Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCM5P33992 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCM5P33992 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCM5P33992 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCM5P33992 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCM5P33992 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM5P33992 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM5P33992 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM5P33992 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM5P33992 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM5P33992 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM5P33992 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM5P33992 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM5P33992 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM5P33992 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM5P33992 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM5P33992 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM5P33992 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM5P33992 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM5P33992 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM5P33992 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM5P33992 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM5P33992 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM5P33992 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM5P33992 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM5P33992 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM5P33992 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM5P33992 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM5P33992 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM5P33992 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM5P33992 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM5P33992 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM5P33992 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM5P33992 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM5P33992 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM5P33992 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM5P33992 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM5P33992 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MCM5P33992 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM5P33992 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM5P33992 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM5P33992 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM5P33992 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM5P33992 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM5P33992 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM5P33992 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM5P33992 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM5P33992 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM5P33992 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM5P33992 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM5P33992 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM5P33992 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM5P33992 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM5P33992 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM5P33992 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM5P33992 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM5P33992 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM5P33992 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM5P33992 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM5P33992 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM5P33992 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM5P33992 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM5P33992 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM5P33992 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM5P33992 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM5P33992 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM5P33992 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM5P33992 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM5P33992 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM5P33992 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM5P33992 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM5P33992 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM5P33992 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM5P33992 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM5P33992 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM5P33992 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM5P33992 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM5P33992 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM5P33992 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCM5P33992 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCM5P33992 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM5P33992 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM5P33992 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM5P33992 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM5P33992 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM5P33992 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM5P33992 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM5P33992 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM5P33992 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM5P33992 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM5P33992 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM5P33992 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MCM5P33992 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCM5P33992 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCM5P33992 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCM5P33992 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCM5P33992 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MCM5P33992 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM5P33992 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM5P33992 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms