Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA10P31260 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HOXA10P31260 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA10P31260 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HOXA10P31260 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.9 ms