Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SERPINB3P29508 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPINB3P29508 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms