Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB6P17509 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB6P17509 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB6P17509 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB6P17509 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB6P17509 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms