Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARGP13631 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARGP13631 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARGP13631 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARGP13631 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARGP13631 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARGP13631 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARGP13631 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARGP13631 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARGP13631 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARGP13631 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARGP13631 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARGP13631 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARGP13631 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARGP13631 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARGP13631 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARGP13631 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RARGP13631 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RARGP13631 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RARGP13631 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARGP13631 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARGP13631 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARGP13631 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARGP13631 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RARGP13631 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARGP13631 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARGP13631 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARGP13631 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARGP13631 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARGP13631 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARGP13631 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARGP13631 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARGP13631 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RARGP13631 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RARGP13631 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARGP13631 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARGP13631 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARGP13631 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARGP13631 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARGP13631 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARGP13631 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARGP13631 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARGP13631 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RARGP13631 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARGP13631 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARGP13631 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RARGP13631 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARGP13631 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARGP13631 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARGP13631 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARGP13631 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARGP13631 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARGP13631 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RARGP13631 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARGP13631 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARGP13631 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARGP13631 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARGP13631 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARGP13631 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARGP13631 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARGP13631 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARGP13631 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARGP13631 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARGP13631 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARGP13631 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARGP13631 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARGP13631 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARGP13631 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARGP13631 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARGP13631 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARGP13631 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARGP13631 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARGP13631 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARGP13631 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARGP13631 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARGP13631 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARGP13631 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARGP13631 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARGP13631 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARGP13631 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARGP13631 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RARGP13631 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARGP13631 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARGP13631 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARGP13631 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARGP13631 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RARGP13631 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARGP13631 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RARGP13631 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARGP13631 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARGP13631 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARGP13631 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARGP13631 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARGP13631 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARGP13631 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARGP13631 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARGP13631 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARGP13631 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RARGP13631 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARGP13631 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms