Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS17P08708 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS17P08708 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS17P08708 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS17P08708 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS17P08708 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS17P08708 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS17P08708 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS17P08708 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS17P08708 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS17P08708 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS17P08708 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS17P08708 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS17P08708 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS17P08708 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS17P08708 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS17P08708 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS17P08708 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS17P08708 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS17P08708 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS17P08708 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS17P08708 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS17P08708 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS17P08708 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS17P08708 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS17P08708 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS17P08708 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS17P08708 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS17P08708 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS17P08708 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS17P08708 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS17P08708 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS17P08708 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS17P08708 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS17P08708 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS17P08708 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS17P08708 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS17P08708 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS17P08708 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS17P08708 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS17P08708 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS17P08708 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS17P08708 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS17P08708 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS17P08708 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS17P08708 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS17P08708 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS17P08708 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS17P08708 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS17P08708 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS17P08708 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS17P08708 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS17P08708 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS17P08708 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS17P08708 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS17P08708 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS17P08708 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS17P08708 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS17P08708 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS17P08708 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS17P08708 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS17P08708 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS17P08708 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS17P08708 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS17P08708 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS17P08708 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS17P08708 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS17P08708 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS17P08708 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS17P08708 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS17P08708 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS17P08708 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS17P08708 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS17P08708 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS17P08708 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS17P08708 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS17P08708 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS17P08708 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS17P08708 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS17P08708 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS17P08708 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS17P08708 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS17P08708 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS17P08708 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS17P08708 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS17P08708 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS17P08708 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS17P08708 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS17P08708 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms