Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1O95273 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1O95273 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms