Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN2BO60939 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN2BO60939 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms