Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLXNB1O43157 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLXNB1O43157 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLXNB1O43157 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLXNB1O43157 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLXNB1O43157 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PLXNB1O43157 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLXNB1O43157 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms