Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARPC5O15511 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms